仁济医院建于1844 年，是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成，是一个学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院：东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内，于1999 年10 月建成投入使用，占地86875 平方米，建筑面积208404 平方米；西院位于黄浦区中央商务区内，毗邻外滩，占地7811 平方米，建筑面积31959 平方米；南院位于闵行区浦江镇，紧邻世博家园，占地68497 平方米，建筑面积82590 平方米；北院位于巨野路灵山路，占地6667 平方米，建筑面积17350 平方米；肿瘤所位于斜土路，总建筑面积7523 平方米，由肿瘤流行病学研究室、癌基因与相关基因国家重点实验室及十三个课题组组成。
医院东、西、北三个院区目前总核定床位1450 张，南院核定床位600 张。截止2012 年底，医院共有职工3099 人，其中正、副高级职称专家373 名；博导57 名、硕导131 名。医院设有42 个临床医技科室：消化科、心内科、血液科、风湿病科、老年病科、呼吸科、肾脏科、神经内科、内分泌科、肿瘤科、康复科、急诊科、核医学科、放射诊疗科、泌尿科、普外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神经外科、肝脏外科、整形外科、麻醉科、中医科、儿科、眼科、妇产科、生殖医学科、耳鼻咽喉- 头颈外科、皮肤科、感染科、口腔科、营养科、放射科、超声医学科、病理科、检验科、药剂科、输血科、内科门诊、健康保健中心。
近年来，医院申请到的科研项目及专利逐年递增，2012 年纵向科研经费达1.11 亿元，包括国家级的973 计划、863 计划、国家自然基金（重点）项目等；并获得多项国家科技进步奖、中华医学科技奖、高等学校科技进步奖等；先后共有几百人次入围各级人才培养计划，包括973 首席科学家、长江特聘教授、卫生部有突出贡献中青年专家、国家杰出青年、教育部新世纪人才、上海市领军人才和东方学者等。医院与美国、法国、日本等近十个国家的二十多所医学院校建立了学术交流和友好合作关系。
2001 年，医院在全市三级综合性医院中率先推行ISO9001 质量管理认证体系，并每年通过质量认证。医院还积极探索集团化管理，直接托管嘉定区中心医院和长宁区同仁医院两家分院，与社会合作的仁济医
疗管理公司，通过市场化运作，以品牌效应领先，把优秀的医院管理模式在长三角地区加以推广。涉外的全康国际医疗中心为驻沪外籍人士提供优质的服务。